数百数千あるファイルを一括文字コード変換したい時に使うコマンド。（私はzen-cart-v1.3.0.2-l10n-jp-6がEUC-JPであることが気に入らなくてUTF-8に一括変換）

find . -type f | xargs -n 10 nkf -w --overwrite

 find でカレントディレクトリ内のファイルをすべて拾って(-type f)、そのファイルリストをxargsに渡します。-n 10のところでファイルリストを一度に渡す数を調整します。膨大な量が予想される場合は-n 50とかにするとよいです。それからnkfに渡して-wでutf-8に文字コード変換。変換後はそのまま上書きしてしまって--overwriteしてしまいます。殆ど失敗しないので大丈夫。（ですが、コピーしておいた方がいいかもです。）
 

オプション	意味
-e	EUC に変換
-s	SJIS に変換
-w	UTF-8 に変換
-j	JIS に変換
-Lu	UNIX 改行コード (LF) へ変換
-Lw	Windows 改行コード (CR+LF) へ変換
-Lm	(Macintosh 改行コード (CR) へ変換)
--overwrite	ファイルを上書き

-Lmは殆ど使わない。-wLuが一番よく使う感じでしょうか。

　文字コードの変換後は、nkfでもってきちんと文字コード変換できたか確認します。（結構ちゃんとできてる。）ちなみに英数字のみのファイルはASCIIとなってしまうのでご注意。日本語が混じっているファイルで確認してください。

nkf -g xxxx.php

とかこんな感じです。